為了分析帶土的出招和能力，扉間與初代火影的木分身聯手對抗十尾人柱力模式的宇智波帶土，兄弟二人同時被帶土使用求道玉的流體形態擊碎半身，但扉間在被擊碎的瞬間，不僅將多張起爆符貼在帶土的身上，而且還在帶土的身上做了飛雷神咒印紋樣的標記，扉間的出手速度之快由此可見。隨后柱間的木分身伸出兩條樹藤捆綁住帶土，以便于扉間使用互乘起爆符轟炸帶土。緊接著，扉間無限連續通靈出起爆符并且集中于一點無限連續轟炸帶土。由于此術攻擊范圍大，持續時間長，不僅炸飛了眾多的十尾分裂體，連扉間的穢土身軀與柱間的木分身也因此被炸毀。

　　然而此招卻被帶土使用求道玉的流體形態防御了攻擊，隨后扉間的穢土身軀自行恢復。在千鈞一發之際，扉間利用影分身使用飛雷神之術轉移十尾人柱力宇智波帶土的求道玉，隨后連同求道玉以及帶土一起轉移到了遠處。營救了困境中的四代火影、漩渦鳴人、宇智波佐助，避免了不必要的損失。之后扉間與四代火影使用飛雷神互瞬回旋術配合灼遁·光輪疾風漆黑矢零式擊中帶土，但被帶土使用陰陽遁將其無效化。此時，二代火影憑借自己生前的戰斗經驗冷靜的分析出帶土的能力是以陰陽遁為基礎的術，能夠將所有忍術無效，也就是說即使是穢土轉生的身體，只要中招，也會因為無法轉生而死亡，因此勸誡水門在之后的戰斗中一定要更加謹慎。接著扉間察覺到了帶土不能化解仙術的弱點，以飛雷神之術配合鳴人的仙術螺旋丸瞬間移動至帶土的身后對其造成傷害，并且從鳴人身上感受到了曾經與柱間并肩作戰的感覺。

　　緊接著帶土在地面上制造出神樹并同時釋放出四顆尾獸玉，第二代火影原本打算與水門使用飛雷神術一人轉走一個，但因考慮到即使轉走了兩個，但剩余兩個尾獸玉卻無法轉移的問題而嘗試別的辦法，初代火影告訴大家不用擔心，只要改變尾獸玉的運行軌道就可以，到時候四位火影會想辦法把它們打到海上，并拜托大家制造土遁之壁，自己用樹界降誕將尾獸玉引導向大海，然而柱間的想法立即被帶土徹底打消，帶土使用六赤陽陣封將忍者聯軍封鎖在結界里，之后二代火影意識到只能用飛雷神術把尾獸玉轉移到結界外部去了，隨后二代火影詢問水門能否同時轉移兩個，然而四代火影的飛雷神在無法標記的情況下，一個已經是極限，所以水門嘗試別的辦法。隨后水門打算將尾獸玉連同樹一起轉移到結界外部去，然而這一想法卻被帶土嘲笑，在緊要關頭，鳴人提出了一個主意，水門與鳴人碰拳使自己的查克拉與鳴人的查克拉進行接觸，從而使自己的查克拉與鳴人留在忍者聯軍神樹的查克拉連接了起來，因為忍者聯軍身上附有鳴人和九喇嘛的查克拉，所以使水門成功將忍者聯軍所有人轉移到了結界外部，隨后第二代火影也詳細解說了這是利用了影分身的原理，即便自身的查克拉分散四處，只要有哪怕微量的查克拉殘余，當本體為控制查克拉再次開始凝練時，分散的查克拉便會產生共鳴而聯動。緊接著扉間使用飛雷神之術將兩大九尾完全體化的波風水門與漩渦鳴人轉移至帶土的身后，使用螺旋丸成功擊中帶土，但被帶土使用陰陽遁抵擋。因此與帶土打了平手。

　　此時的帶土已經發動無限月讀，神樹的根莖瘋狂地生長亂竄，所到之處忍者聯軍的查克拉都被吸走，為了營救被神樹分裂體樹藤纏繞住的鳴人，扉間使用水遁水斷波接連切斷了神樹的樹根。之后，扉間以飛雷神術瞬間將鳴人、水門、日斬轉移至忍者聯軍的戰場。期間從鳴人的身上看到了哥哥柱間的影子，深感鳴人在未來會成為超越哥哥柱間的火影。之后扉間以飛雷神之術讓陷入困境中的忍者聯軍脫困，并鼓舞大家不用怕盡管沖。為給我愛羅留出時間救走鳴人，千手扉間瞅準斑自以為得手的瞬間，使用飛雷神斬從斑的背后展開偷襲。經過一番激戰，當扉間使用飛雷神二段瞬間移動至斑的上空開始反攻時。斑使用輪墓將千手扉間定在半空中無法動彈，并利用黑棒封鎖住扉間提煉查克拉的穴道。他斑清楚扉間這招的可怕之處，畢竟弟弟泉奈就是被這招打敗的，所以斑不會讓扉間使用出來。斑也告知穢土身軀的的扉間發揮不出曾經的力量是有原因的。

　　隨后扉間感知到佐助即將到來，為給佐助留出突襲的最佳時機，于是扉間使用水遁·天泣突襲斑，然而卻被斑使用須佐能乎初始形態的手臂防御了攻擊。由于此時的扉間已被斑利用黑棒封鎖住提煉查克拉的穴道。因此使扉間無法拯救佐助，只能眼看著佐助被斑一刀刺穿身體。為了挽救佐助的性命，扉間使用靈魂禁錮術將佐助的靈魂禁錮住一段時間，以此延緩佐助的死亡，其后指導幫助藥師兜成功救治了宇智波佐助，隨后扉間被開啟六勾玉輪回眼并免疫黑棒受到的影響的佐助拔出黑棒，使扉間恢復了自由行動的能力，之后扉間以飛雷神之術將佐助送往戰場，隨后扉間的穢土身軀自行恢復。在宇智波斑發動無限月讀后，由于是穢土轉生之軀的千手扉間和其他三位火影并沒有受到影響。扉間原本打算用苦無砍斷包裹著中了無限月讀人們的樹藤，然而卻沒有一個人醒來，并且很快又有新的樹藤纏了上來。然而，此時的戰況已經更變，神樹正在快速吸取包裹著忍者聯軍的查克拉。隨后扉間感知到雖然斑的查克拉消失但同時又出現了新的查克拉并決定與其他三位火影一同前往查看。

　　為弄清斑的死因，扉間打算利用斑的下半身使用穢土轉生，以此逼問斑當前的戰況，但因活祭品的問題而被柱間否定，隨后四位火影嘗試別的辦法，當柱間觸摸到失敗的斑的下半身時，剎那間，感應到因陀羅、阿修羅、九尾查克拉合二為一的六道仙人出現在四位火影的面前，并詳細告訴眾火影目前的形勢。在大筒木輝夜被封印后，與六道仙人以及其他16位已逝去的五影們共同使出通靈之術，將第七班、九只尾獸以及瀕死狀態的宇智波斑從始球空間轉移回忍者世界。之后由六道仙人解除穢土轉生，靈魂回歸凈土。

　　而猿飛日斬是猿飛佐助之子，自幼能力出眾，從小在初代火影、第二代火影嚴格的教育和悉心的呵護下成長。他與志村團藏、宇智波鏡、秋道取風、水戶門炎、轉寢小春為木葉隱忍者學校的同期學員，由第二代火影千手扉間直接領導。晉升上忍后他們六人加入第二代火影扉間的精銳護衛部隊。平時執行任務時猿飛日斬與志村團藏一組一起行動。他跟團藏有著很深的羈絆，兩人視彼此為競爭對手而一直相互競爭著。在擔任上忍期間，猿飛日斬培育了日后被稱為傳說的木葉三忍——綱手、自來也、大蛇丸。

　　在第一次忍界大戰中，云隱村孤注一擲，投入千余忍者向木葉發動侵襲。第二代火影扉間帶領著村中的精英忍者一起阻止云忍的入侵，守護著忍村，為木葉帶來了勝利。使云隱以戰敗為結果收場。事后，云隱村內部產生了分裂，第二代雷影想停戰與木葉和談，但金角銀角這對任性的兄弟卻不甘心以慘敗收場，他們希望繼續維持戰亂狀態，因此，在雷影與火影的結盟儀式上，金角銀角掀起政變，二人以六道忍具和九尾查克拉的力量兇殘的殺死了自己的老大第二代雷影，同時也讓第二代火影受到了瀕臨死亡的重傷。

　　緊接著，扉間帶領部下突出重圍，金角銀角乘勝追擊，為了保存木葉的幼苗，扉間決定留下斷后。不過，即便是在這種危急關頭，心思縝密的扉間仍為選擇正確的繼承人而暗中考驗著部下，最后團藏因膽怯而遲疑，而猿飛日斬表現出能為了村子舍棄性命的決心，據此，扉間將「火影之位」托付給了日斬。之后第二代火影扉間獨自一人抵擋能夠自如操縱六道仙人的五大忍具、擁有九尾查克拉的金角銀角。經過一場大戰，第二代火影千手扉間為掩護部下撤退力竭而犧牲，金角銀角也死傷慘重。

　　在第二代火影逝去后，日斬與團藏兩人相輔相成，讓木葉村再度成為了最強忍村。若干年后猿飛日斬繼任火影之位，此時的日斬下巴已經長出了胡須，他以火影的身份守護著村子和國家，深深繼承了第二代火影的意志。日斬在繼位火影后任命團藏為火影輔佐，讓水戶門炎與轉寢小春兩人擔任木葉隱村的高層顧問，負責村子中大事的決策，管理木葉政務的機構。日斬是一位深愛著村子、保護居民們的偉大忍者，指導能力出眾，被譽為忍術教授。他提出的方案也被納入忍術學校的課程中。完善了忍者學校的教育體制，使村子走向太平盛世，可說是象征著木葉忍者村的人。第三次忍界大戰結束后，在木葉做出讓步的前提下，木葉與巖忍村簽訂了和約。為了對在戰爭中犧牲的木葉忍者負責，同時迫于木葉高層的壓力，第三代火影主動辭去了火影之位。隨后將火影之位交給自來也的徒弟波風水門。不久后，村里從下忍到中忍甚至連暗部的上忍都陸續下落不明，日斬收到了大蛇丸形跡可疑的情報，于是帶領著暗部精英成員前往禁術基地圍攻大蛇丸，日斬本想殺他，但最后于心不忍，于是讓大蛇丸逃走了。

　　在九尾襲村事件中，第三代火影帶領村子中的精英忍者們企圖阻止九尾，一度將九尾逼出村外，但最終親眼目睹而無法阻止第四代以生命來封印尾獸的結局，其妻猿飛琵琶湖也在看護分娩階段的漩渦玖辛奈的期間，死于襲擊者面具男的手上。盡管四代火影成功擊退了九尾，但為此付出的犧牲實在太大，緊接著木葉高層與村中的忍者們一起討論著選擇合適的火影繼承人，奈良鹿久提出由水門的后一代忍者繼位，但轉寢小春認為他們的經驗還不足以領導眾人，此時猿飛日斬挺身而出，自愿擔此重任，隨后得到了木葉高層水戶門炎、轉寢小春等眾人的支持。猿飛日斬是忍界史上實際執掌火之國最高權力時間最長的火影，也是最長壽的火影。

　　十二年后，在第三場中忍正式考試中，日斬特意邀請了盟友風之國砂隱村的第四代風影一同觀賞這場這場淘汰賽，并設席于其旁。期間由并足雷同擔任日斬的護衛，由于宇智波佐助為趕來參加考試，日斬多次推遲考試時間后佐助仍未來參加，隨后日斬決定取消其資格，但因“第四代風影”的勸阻，日斬打消了此念頭。然而日斬卻沒發現，此時的第四代風影只是大蛇丸變化所為....大蛇丸瞄準我愛羅進入暴走狀態時，利用音隱及砂隱村向木葉隱村發動攻擊。“風影”和他的部下把第三代火影捉到桔梗城樓之上，風影亦露出他的真面目，原來就是自己的學生——大蛇丸。大蛇丸的部下“音忍四人眾”更在城樓上結出“四紫炎陣”，把大蛇丸及第三代火影圍起來，作為他們戰斗的地方，而結界所生之火焰令木葉暗部無法進入。第三代知道要逃出此陣不是一件容易的事。大蛇丸在對戰前曾一度流下淚來，第三代認為殺害老師的他還是會傷心，大蛇丸則聲稱只是打呵欠才流淚，令在場的卡卡西、阿凱和暗部傻眼，隨后向第三代火影發出挑戰。