董卓被王允成功謀殺以后，百姓歡慶，長安是夜燈火闌珊。宮中王允和誅董團隊思考著下一步動作。董卓伏誅，按理說接下來便是夷其后人，滅三族。王允接著提出弄掉董卓的追隨者，余者附議。
當時名士蔡邕在家中，突然聽到這一消息，驚詫之間，不由得發出嘆息。不是為董卓鳴不平，只是感慨世事多舛。結果有人舉報蔡邕與董卓有勾結，并說蔡邕對于董卓被誅感到惋惜。
在司徒王允眼里，這是不可原諒的。早在董卓大廈將傾時，整個長安的眼線都是我王允的了。蔡邕如此懷念董賊，令人將其帶到大殿之上。正在笑瞇瞇的與各位百官，地方勢力交談的王允勃然變色斥責他，蔡伯喈，蔡大學士，你身為王臣，國主危難不思反戈，董卓伏誅反倒嗟痛，是什么意思？
蔡邕回答道，我一學士，有何作為，空腹文章，無力也。司徒大人，罪臣知錯，可否令我歸鄉乞老？
王允一聽，你仗著你是名士，我就不敢動你，區區貶謫？讓你回家？董卓待你如何？“三日之內，周歷三臺”，先是拜其為侍御史，又轉為侍書御史，再遷為尚書。初平二年，拜你為左中郎將，封高陽鄉侯。誰人有你如此待遇？我尚書令都不如你啊？來人，下放廷尉，處以死刑。
王允此時內心權欲膨脹，董卓已死，便以為天下盡在掌中。正是“董卓我都能殺，誰人不能殺？”的心理暗示作祟。
獄中，蔡邕心情失落，見到好友馬日磾，請求幫助，企望以鯨首之刑，只為續寫《漢史》。
于是，馬日磾向王允勸說：“蔡邕是曠世逸才，并且熟知兩漢的事，應該讓他繼續修史，以為一代大典。而且蔡邕一向以忠孝著名，而現在他沒有犯什么罪名，這樣誅殺會令人民失望。”
但王允卻辯駁：“當日漢武帝沒有殺司馬遷，令他寫了毀謗的書（史記）并流傳后世。現在東漢衰落，四處都有征戰，不可以讓佞臣在幼主（漢獻帝）身邊寫史書。不但無益于皇帝的圣德，更令我們等人遭到他的非議。”王允留著一個筆桿子，去非議自己的歷史，使自己這些人遭遇“不白之冤”，胡寫亂寫豈不哀哉？于是，既然下獄，不給其退路，必殺之。
馬日磾離開后，向人稱王允這樣殺蔡邕、斷絕史書的寫作是滅掉國紀、廢棄國典，不會在位太久。當時并不乏如蔡邕一般，平白無故因與董卓有所牽連而被冤枉，荒唐入獄者。只是因為蔡邕實在是大漢名士，飛白體的創造人，一代才女蔡文姬的父親，受到眾人推舉的大文豪。于是，王允殺害蔡邕才顯得那么突出。而王允殺害蔡邕這個名士，也是不合情理的。你殺了蔡邕，落下把柄無數，后人如何評價于你。
由此，可以證明，王允的內心膨脹速度極快，大概是在擺脫背后控制，無人可以否決自己的觀念作祟。
事后，王允，黃琬，鄭公業，士孫瑞，呂布，李肅等參與此次誅董事件的人齊聚司徒府，這也是他們之間最后一次會見。期間，王允提出董卓滅了，長安城中余黨抓了，接著便是外面的駐軍，奉先（呂布字奉先）你和子彥（李肅字子彥）率軍滅掉牛輔，剩下的四個將領（李傕，郭祀，樊稠，張濟）到時候赦免了吧。君榮（士孫瑞字君榮）啊，你去把城中的兵都收到一起保護長安城，至于黃太尉，鄭公業兩位大人啊，安定內政還是需要靠你們啊。各位和我共進退，多謝了。明日定當論功行賞。
黃琬與鄭公業走出司徒府時互相打量，黃琬道，原本一起在商議，現在全成了他王允一人施發命令。鄭公業道，人啊，權力變大了，又沒了懸在頭上的威脅，那么心自然也就變了。士孫瑞道，誅董是王允之功，無我也。他王允這位子坐不長啊。
當初，中郎將牛輔（董卓之婿）奉董卓之命，率一支軍駐守陜縣。此刻，呂布派出李肅誅殺牛輔，牛輔在交戰中雖勝一陣，但大勢已去，營中夜有叛逃，牛輔隨后被部下所殺，王允以該軍解散了之。
第二日，五更時分，眾人來朝，小皇帝坐在龍座之上，看著下面一幫喜氣洋洋的大臣面容，心里也很高興，不過看不見董叔叔，哪位逗自己開心，給自己送上珍饈美味的叔叔去哪里了？
在黃琬率大臣在殿中與小皇帝苦苦等待中，穿著華貴衣衫的王允姍姍來遲，身后跟著剛剛剿滅牛輔叛軍的穿著一身血衣的呂布。王允臉上無悲無喜，旁邊眾人又想開口斥責其來晚之人，均被旁人按住。原來王允是董卓的朝中代言人，如今王允自己當了老大，更惹不起了。
王允在經過一番對于誅董事件的慷慨陳詞過后，開始論功行賞。首先是給自己錄尚書事，然后以呂布為奮武將軍、假節（某方面代替皇權），禮儀如同三公（太傅、司徒、司空），封溫侯，與王允共執朝政。而李肅在征討牛輔時兵敗被呂布所殺。而士孫瑞在此之前，則是請求不予其功，蓋是王允之功。
于是乎，尚書王允，溫侯呂布一個掌政，一個掌軍，分配合理，王允總管朝廷大權。王允剛愎自用，做事全憑個人思想，對于呂布，只當做一個可任意驅使的軍官。大漢朝廷就完全落入了王允一個人手中。
王允在大肆抓捕朝廷董卓余黨時，長安城外面董卓的四個部將李傕、郭祀、樊稠、張濟上書請求赦免其等罪過。對于董卓統領的涼州軍，一開始打算赦免的王允，大改念頭，改了主意，“此輩無罪，從其主耳。今若名為惡逆而特赦之，適足使其自疑，非所以安之之道也。”故此，未予實施不了了之。
結果便是權利欲望膨脹的王允，選擇了干掉這四人。既然王允不給李傕他們活路，那么也休想安穩下去。然而王允還沒有應對之法，準備細軟逃亡涼州的李傕四將此時卻在賈詡的授意下整理軍團，開始了復董行動，為董卓董相國不白之死、不陳之冤報仇雪恨，長安危矣。
于是乎，執政僅僅二月的尚書事王允正中了馬日磾“廢紀滅典，其能長久。”之語，繼洛陽一把火后，長安又將陷入一場浩劫之中。