在鋼鐵俠3的劇情世界里，鋼鐵俠托尼·斯塔克因為受到復聯1紐約事件的刺激，陷入了焦慮之中。

　　而這時，在十幾年前曾被托尼·斯塔克羞辱過的一個瘋狂科學家基里安博士帶著自己的研究成果對其展開了報復行動。

　　而基里安的這個研究成果就是絕境病毒，一種存在著致命的缺點，卻又可以大幅度增強人類力量的生物病毒。

　　這項病毒的研究最開始是由一個和斯塔克有過一夜情的女生物學家瑪雅博士開...