阿爾薩斯端木帶領著黑羽艦隊到來，一萬艘黑色無光的森然戰艦，排列在十萬艘智械軍團戰艦后面，就在這時，智械軍團所有戰艦停止了運行。

　　一晃二十年過去，李林，瓦西里，陳星海，申如花和卓爾那蘭，成為了新的星際艦隊大艦隊長，令狐穩繼承阿爾薩斯的位置，開始了更加前沿的科學研究，托勒密接替冷云，成為突擊軍團總指揮官，自從二十年前太陽系危機以來，人類進步了很多，齊洛在最關鍵一刻，停止了智械軍團主腦運行，并損失自身意識，轉化了智械主腦的全部程序，當智械軍團重啟以后，迅速幫助人類開始重建家園，并收攏全部可以控制的艦隊，總計三十萬新式仿生戰艦，配合另一個到達人類控制星域的高級文明，和星際艦隊一起打敗了曾經控制它的高級文明勢力，保持了整個銀河的和平。

　　齊洛的同伴們有的選擇隱居，有的飛向宇宙，新生的智械軍團主腦和塞拉爾行星一起改造，兩顆行星裝置了大型助推器，開始了一起在宇宙流浪旅行，令狐穩帶領團隊掌握了空間鎖定技術，同時也學會了蟲洞創造和穩定技術，實現了人工蟲洞和固定星門建造，人類的飛船自此可以更快的飛向深空宇宙。

　　由于和智械軍團的戰爭，導致人類原先控制的星域資源大幅度減少，新的行星改造技術不斷誕生發展升級，人類戰艦已經可以不用礦物質，僅僅依靠生物質轉換就可以實現堅固船體和能量運用，和其他高級文明的交流讓人類意識到宇宙的廣闊和深邃，隨著科技再次爆發，人類生命也極大提高，意識能量開始認知，漸漸理解了傳說中修仙文明的本質和本源，最終走向了長達千年的和諧共生，未來，幸福美滿。