新廉眼里噙滿了淚水，他都答應(yīng)了下來，很快求真便斷氣了。新廉決定解剖求真的尸體，但面臨著社會風(fēng)俗的壓力，他只好秘密進(jìn)行了解剖。

　　在顯微鏡下，新廉清楚地看到了一種橢圓形疫菌，這是鼠疫桿菌。接下來他雇了好些人去捕捉老鼠，他們解剖了幾百只老鼠，卻未發(fā)現(xiàn)一例帶鼠疫桿菌的。這讓新廉得出了一個結(jié)論，此次鼠疫無需通過動物媒介，人與人之間可以直接傳染。

　　新廉向朝廷呈報(bào)了此結(jié)論，他還提出了初步防疫措施：控制人員流動，發(fā)現(xiàn)鼠疫的地區(qū)必須隔離起來。無感染的人員出入都必須持證，可以追查其行蹤。大量制作口罩，增加醫(yī)生。

　　新廉叫人把阿呆接了過來，他認(rèn)為此病傳染極快，阿呆那邊亦不安全了。阿呆得知求真的死訊后，茶不思，飯不想，好幾日都未進(jìn)食。

　　由于鼠疫已經(jīng)向南擴(kuò)散了，朝廷很快便批準(zhǔn)了新廉的請求，而且還讓當(dāng)?shù)毓俦爮乃恼{(diào)遣。

　　得到朝廷的批準(zhǔn)后，新廉立即派官兵把有感染的地區(qū)隔離了起來，建起了一座又一座的隔離站，并分配了醫(yī)務(wù)人員。接著他封鎖了道路，把人員的活動范圍限制在了自己所在的區(qū)域。確實(shí)需要跨區(qū)域的先隔離起來，檢測觀察后，沒感染的可持證出入。

　　接下來新廉派人將有感染之人移送至隔離站，進(jìn)行相應(yīng)的救治。他讓人印刷了大量防疫宣傳紙張，分發(fā)給各家各戶。新廉還臨時征集了許多護(hù)工、消毒工和埋葬工，讓他們穿上防護(hù)服，并佩戴口罩。由士兵把拋棄的尸體收集起來，埋在亂墳崗。家里有人感染過的都要進(jìn)行消毒，家庭成員都需要居家隔離觀察。

　　隔離站內(nèi)按照病人的病情，分為重癥區(qū)、輕癥區(qū)、疑似病區(qū)。按不同病情提供相應(yīng)的治療，亦避免了他們之間的交叉感染。

　　新廉實(shí)施了這些措施后，疫情迅速被遏制住，新增感染人數(shù)快速下降。入春后，便沒有新增的感染者了。這場試卷東北四個月之久的浩劫終于結(jié)束了。

　　在疫情結(jié)束后，人們紛紛燃放鞭炮以示慶賀，在眾人歡慶之余，新廉來到了亂墳崗。看著這堆積如山的尸體，他憂心忡忡，他擔(dān)心這個墳場會變成一個新的鼠疫桿菌發(fā)源地。如若有什么動物接觸到這些尸體，再傳染到人身上，那么過去所作的一切努力都將化為烏有。

　　新廉決定燒了這些尸體，他跟衙門的人說了后遭到了強(qiáng)烈的反對。附近的百姓得知新廉要燒了亂墳崗的尸體后，都聚集到了衙門。很快，衙門外的百姓越聚越多，他們要求讓死者入土為安。

　　這些百姓的舉動讓新廉有些犯難，他對著這些百姓喊話，欲解釋燒尸體的原因，但無人聽他的。新廉便決定先說服縣太爺，他跟縣太爺說明了此事的利害關(guān)系。縣太爺擔(dān)心疫情再次爆發(fā)，自己的烏紗帽會不保，便決定同新廉一起上書朝廷，讓皇帝下旨燒了這些尸體。同時他出了很多告示說明燒尸體的原因，又讓各地鄉(xiāng)紳安撫百姓。

　　朝廷那邊覺得新廉所說的極為有理，便下了圣旨，讓新廉負(fù)責(zé)焚燒尸體。百姓們雖然不情愿，但皇帝的圣旨誰也不敢違抗。

　　新廉雇了幾百人去燒尸體，他們在尸體上澆上油，幾萬名百姓呆呆地看著這些尸體被燒成了灰。這些尸體被燃燒殆盡后，新廉懸著的心終于落地了。

　　新廉此次能迅速控制住疫情，讓朝廷非常滿意。皇帝在紫禁城接見了新廉，給了他許多賞賜。新廉在朝堂上發(fā)表了自己對此次疫情的看法，他對皇帝說道：“此次疫情傳播如此之快，死的人如此之多，主要是因?yàn)槿藗儗σ咔榈恼J(rèn)識不夠。我們靠海外學(xué)來的醫(yī)學(xué)知識查清了病因，才得以實(shí)施相應(yīng)的防疫措施。我們應(yīng)當(dāng)像其他國家一樣，放棄舊醫(yī)，學(xué)習(xí)新醫(yī)學(xué)，這樣才可以進(jìn)步。”

　　新廉所說的讓幾個大臣很不滿，放棄舊醫(yī)就是斷了他們的財(cái)路。他們相互使了眼色后，其中一人站出來說道：“我們的醫(yī)術(shù)是幾千年的智慧，博大精深，講究的是治本。”

　　新廉說道：“什么治標(biāo)治本的，一個人心臟病突發(fā)，不急救的話馬上就得死；一個人腳斷了，不馬上把他的斷腳接回去他就得瘸；一個人胸腔里插入一把尖刀，不馬上動手術(shù)他就得死；一個人大動脈出血，失血過多時，不馬上輸血他就會沒命......”

　　新廉正說著，一大臣接口道：“我看新廉這段日子為了疫情的事非常辛苦，一定很累了，還是讓他先回去休息吧”

　　其他幾個大臣附和道：“說的對，說的對，應(yīng)該先讓他回去好好休息一下。”

　　以是，他們便讓新廉出去了。

　　這之后，新廉回了趟家鄉(xiāng)，見了甄掌柜。而后又回來跟一些有識之士辦了幾所醫(yī)院，他們欲讓新醫(yī)院遍地開花，用新醫(yī)學(xué)造福更多的百姓。

　　新廉的這一舉動讓那幾個大臣憤懣不已，他們決定除掉新廉。有人給新廉通風(fēng)報(bào)信，新廉當(dāng)機(jī)立斷，帶著阿呆去海外了。他給阿呆起了個名字，叫藥厘正。