根據格拉吉歐的描述，他在回到以太樂園的時候這里就被摧毀了一大半。

　　無數的究極異獸不斷襲擊過往的人類和寶可夢，不少寶可夢都被一層黑色的能量席卷。

　　在他打算和這群究極異獸戰斗之際，他遇到了一個神秘的少年。

　　那個神秘少年使用了一只漆黑無比的寶可夢，這只寶可夢十分強大，僅一個影子球就將格拉吉歐的全部寶可夢全部擊敗。

　　不過這個神秘少年并沒有趕盡殺絕，他在擊敗格拉吉歐...